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Project Selected Spr Newest Outdated Ignored
altree 1.3.1 1 1.3.1 1.0.1
amap-align 2.2 1 2.2 2.2git20080214.600
bedtools 2.25.0 13 2.29.29 2.28.0 2.27.13 2.26.04 2.25.0 2.21.0 2.18.0 2.17.0 2.15.0 2.14.3 v2.27.1.r0.g1de417b9
bibus 1.5.2 7 1.5.26 1.5.1 1.4.0
bioperl 1.6.924 6 1.7.72 1.7.2 1.7.1 1.6.9242 1.6.923 1.6.901 1.6.9 9999 1.0070022
bioperl-run 1.6.9 3 1.7.3 1.7.2 1.7.1 1.6.92 20161220 9999
bitops 1.0 1 1.0
boxshade 3.3.1 2 3.3.12
bwa 0.7.12 12 0.7.1711 0.7.16a 0.7.153 0.7.12 0.7.10 0.7.5a 0.6.22 0.6.1 0.5.9
clean-crypto 1 1 1
clustalw 2.1 13 2.112 1.832
clustalx 2.1 9 2.19
cluster3 1.52a 1 1.59 1.57 1.53 1.52a 1.52 1.50
dialign 2.2.1 3 2.2.13
dialign-t 1.0.2 1 1.0.2
embassy-domainatrix 0.1.650 2 0.1.6602 0.1.650 0.1.0
embassy-domalign 0.1.650 2 0.1.6602 0.1.650 0.1.0
embassy-domsearch 0.1.650 2 0.1.6602 0.1.650 0.1.0
embassy-phylip 3.69.650 1 3.69.660 3.69.650 3.69
emboss 6.6.0 14 6.6.011 6.5.7 6.4.0 6.3.1 6.0.1
emboss-explorer 2.2.0 2 2.2.02
epcr 2.3.12 1 2.3.12
euca2ools 3.1.0 11 3.4.15 3.3.1 3.2.0 3.1.0 3.0.4 3.0.2 2.1.42 2.1.3 2.0.0bzr516 1.3.1 1.1
exonerate 2.2.0 10 2.4.08 2.2.03
fastdnaml 1.2.2 4 1.2.24
fastlink 4.1P 2 4.1P2
fastx-toolkit 0.0.14 7 0.0.146 0.0.13.1 0.0.13
filo 1.1.0 1 1.1.0 1.1
gbrowse 2.54 2 2.56 2.54 2.48 2.42
getdata 0.2 7 0.14b 0.10.04 0.9.0 0.8.9 0.2 0.1
glam2 1064 1 1064
gnustep-biococoa 2.2.2 3 2.2.23
htsjdk 2.0.1 1 2.18.2 2.14.3 2.8.1 2.0.1
htslib 1.2.1 13 1.10.27 1.97 1.7 1.5 1.3.2 1.2.1 1.1 0.2.0rc3
kalign 2.03 4 3.2.3 3.1.1 2.032 2.0.4
last 712 5 10612 1060 10472 1045 983 963 938 921 830 712 490 393 299 230 189
libgtextutils 0.7 8 0.76 0.6.2 0.6.1 0.62
mafft 7.271 9 7.467 7.464 7.4535 7.429 7.407 7.397 7.394 7.310 7.307 7.305 7.273 7.271 7.266 7.215 7.205 7.123 7.050 6.850
maq 0.7.1 3 0.7.13
maqview 0.2.5 2 0.2.52
melting 4.3.1 1 5.2.0 4.3c 4.3.1
mime-support 3.59 5 3.644 3.63 3.622 3.60 3.59 3.58 3.54 3.51
mipe 1.1 1 1.1
mira 4.9.5 3 4.9.6 4.9.5 4.0.22 4.0 3.4.0.1 0.2.1_beta
mocker 1.0 1 1.0
mummer 3.23 6 3.234 3.22 3.20 4.0.0.b2.2
muscle-sequence-alignment 3.8.31 11 3.8.15517 3.8.315
njplot 2.4 2 2.4 2.32
paraclu 9 1 9
perl:ace 1.92 5 1.922 1.920.03
Project Selected Spr Newest Outdated Ignored
perl:algorithm-munkres 0.08 11 0.086 0.80.05
perl:bio-mage 20030502.3 2 20030502.32
perl:bio-mage-utils 20030502.0 2 20030502.02
perl:bio-primerdesigner 0.07 2 0.072 0.02
perl:bio-samtools 1.41 3 1.432 1.41 1.39 1.32 1.430.0
perl:bio-scf 1.03 3 1.033
perl:convert-binary-c 0.78 11 0.793 0.785 0.76 0.790.02 0.780.03 0.770.0 0.760.0
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perl:go 0.15 1 0.15 0.13
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perl:mqdb 0.954 2 0.9542
perl:net-amazon-s3-tools 0.08 2 0.082
perl:tfbs 0.7.0 1 0.7.1 0.7.0 0.6.1 0.6.0 0.5.svn.20100421
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picard-tools 1.113 4 2.22.8 2.22.4 2.21.8 2.20.1 2.18.25 2.8.1 1.113 1.105 1.46
plink 1.07 8 1.90_pre140514 1.90.b6.17 1.077
poa 2.0 2 2.0 2
primer3 2.3.6 9 2.4.05 2.3.73 2.3.65 2.3.1 2.2.3
probcons 1.12 3 1.123
proda 1.0 1 1.0
pv-grub-menu 1.3 1 1.3
python:biopython 1.66 15 1.774 1.767 1.752 1.742 1.735 1.72 1.712 1.703 1.69 1.682 1.664 1.642 1.63 1.61 1.582
python:pysam 0.7.7 7 0.15.44 0.15.2 0.15.1 0.15.0 0.14 0.11.2 0.10.0 0.9.1.4 0.7.7 0.6
r:combinat 0.0 8 0.0.83 0.0-83 0.0_8 0.0
r:epitools 0.5 3 0.5-10.12 0.5-10 0.5
r:genetics 1.3.8.1 5 1.3.8.1.25 1.3.8.1.1 1.3.8.1 1.3.8 1.3.6
r:other-bio3d 1.1 1 1.1
rnahybrid 2.1.2 1 2.1.2 2.1.1 2.1
samtools 0.1.19 16 1.108 1.98 1.7 1.5 1.3.12 0.1.202 0.1.196 0.1.183
seaview 4.5.4.8 8 5.0.23 5.03 4.73 4.6.4 4.6.2.1 4.6.1.2 4.62 4.5.4 4.5.3.1 4.4.2 4.3.5 4.3.1
sigma-align 1.1.3 1 1.1.3
snappy-java 1.1.2.1 10 1.1.7.5 1.1.7.33 1.1.7.22 1.1.7.1 1.1.4 1.1.2.62 1.1.2.43 1.1.2.1 1.1.0.1 1.0.5.4 1.0.4.13 1.0.3rc3 1.0.3_rc3 1.0.3-rc3
sra-sdk 2.3.5 1 2.10.6 2.9.3 2.8.2 2.8.1 2.3.5 2.1.7a
srf 0.1 2 1.0 0.1
ssake 3.8.4 1 4.0 3.8.4 3.8.2 3.8.1 3.8
staden-io-lib 1.14.6 4 1.14.12 1.14.113 1.14.9 1.14.8 1.14.6 1.13.7 1.13.5 1.12.42
tree-puzzle 5.2 5 5.3rc16 5.25
treeviewx 0.5.1 3 0.5.1_20100723 0.5.12 0.5.1git20100823.7
umegaya 1.0 1 1.0 0.13
velvet 1.2.10 7 1.2.107 1.1.07 1.0.18
wise2 2.4.1 9 2.4.16 2.4.0_alpha 2.2.04

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