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autodocksuite 4.2.3 2 4.2.62 4.2.5.1 4.2.3
bedtools 2.14.3 13 2.29.29 2.28.0 2.27.13 2.26.04 2.25.0 2.21.0 2.18.0 2.17.0 2.15.0 2.14.3 v2.27.1.r0.g1de417b9
bibus 1.5.1 7 1.5.26 1.5.1 1.4.0
bioperl 1.6.901 6 1.7.72 1.7.2 1.7.1 1.6.9242 1.6.923 1.6.901 1.6.9 9999 1.0070022
bwa 0.6.1 12 0.7.1711 0.7.16a 0.7.153 0.7.12 0.7.10 0.7.5a 0.6.22 0.6.1 0.5.9
cufflinks 1.3.0 5 2.2.14 2.1.1 v2.2.1.r83.gb4fa050 2.2.1.89
embassy-domainatrix 0.1.0 2 0.1.6602 0.1.650 0.1.0
embassy-domalign 0.1.0 2 0.1.6602 0.1.650 0.1.0
embassy-domsearch 0.1.0 2 0.1.6602 0.1.650 0.1.0
emboss 6.3.1 14 6.6.011 6.5.7 6.4.0 6.3.1 6.0.1
exonerate 2.2.0 10 2.4.08 2.2.03
fastx-toolkit 0.0.13.1 7 0.0.146 0.0.13.1 0.0.13
hmmer 3.0 16 3.310 3.2.12 3.1b22 3.1beta2 3.1_beta2 3.1b1 3.03 3 2.4i2 2.3.23
infernal 1.0.2 7 1.1.36 1.1.2 1.1.1 1.1rc4 1.0.22
last 189 5 10612 1060 10472 1045 983 963 938 921 830 712 490 393 299 230 189
libgtextutils 0.6.2 8 0.76 0.6.2 0.6.1 0.62
mummer 3.22 6 3.234 3.22 3.20 4.0.0.b2.2
muscle-sequence-alignment 3.8.31 11 3.8.15517 3.8.315
perl:bio-graphics 2.24 5 2.403 2.39 2.372 2.24 2.400.0 2.390.0
perl:bio-samtools 1.32 3 1.432 1.41 1.39 1.32 1.430.0
perl:convert-binary-c 0.76 11 0.793 0.785 0.76 0.790.02 0.780.03 0.770.0 0.760.0
perl:data-stag 0.11 13 0.148 0.13 0.11 0.140.05
perl:math-random 0.71 14 0.728 0.712 0.720.04 0.710.0
perlprimer 1.1.21 3 1.2.42 1.2.3 1.1.212
picard-tools 1.46 4 2.22.82 2.21.8 2.20.1 2.18.25 2.8.1 1.113 1.105 1.46
plink 1.07 8 1.90_pre140514 1.90.b6.17 1.077
primer3 2.2.3 9 2.4.05 2.3.73 2.3.65 2.3.1 2.2.3
python:biopython 1.58 15 1.775 1.766 1.752 1.742 1.735 1.72 1.712 1.703 1.69 1.682 1.664 1.642 1.63 1.61 1.582
python:m2crypto 0.21.1 26 0.35.216 0.32.02 0.31.04 0.30.14 0.29.0 0.28.22 0.27.0 0.26.4 0.25.12 0.24.05 0.23.02 0.22.6rc4 0.22.5 0.21.14 0.20.22 0.19.1
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r:combinat 0.0 8 0.0.83 0.0-83 0.0_8 0.0
r:epibasix 1.1 3 1.53 1.3 1.1
r:epitools 0.5 3 0.5-10.12 0.5-10 0.5
r:g.data 2.0 3 2.43 2.3 2.0
r:genetics 1.3.6 5 1.3.8.1.25 1.3.8.1.1 1.3.8.1 1.3.8 1.3.6
r:haplo.stats 1.4.4 3 1.7.93 1.7.7 1.7.1 1.6.11 1.6.3 1.4.4
r:randomforest 4.6 8 4.6-144 4.6.142 4.6.10 4.6.7 4.6
r:rocr 1.0 5 1.0-112 1.0-7 1.0_5 1.0
samtools 0.1.18 16 1.108 1.98 1.7 1.5 1.3.12 0.1.202 0.1.196 0.1.183
seaview 4.3.1 8 5.0.23 5.03 4.73 4.6.4 4.6.2.1 4.6.1.2 4.62 4.5.4.8 4.5.4 4.5.3.1 4.4.2 4.3.5
velvet 1.1.07 7 1.2.107 1.1.07 1.0.18

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