Projects

183 project(s) on this page

Project Selected Spr Newest Outdated Ignored
afni 22.0.21 20.3.03 20.1.16 3 23.2.102 23.2.06
angsd 0.933 3 0.940 0.937 0.935
ants-advanced-normalization-tools 2.4.3 5 2.5.0 2.4.42 2.4.2 2.2.02 2.1.0 1.9.2+svn680.dfsg 2.4.2.r31.g74afcc56 20220205
aocl-sparse 9999 2.2 2 4.1
arrayfire 3.8.0 3.7.3 3.7.2 9 3.9.0 3.8.32 3.8.1 3.8.0 3.7.3 3.6.4 3.5.12 3.3.2 3.2.2 3.8.rc.r458.g787d927 master
atompaw 4.1.1.0 6 4.2.0.32 4.2.0.2 4.1.1.0 4.1.0.6
bam-readcount 9999 0.8.0 2 1.0.1
bbmap 38.87 6 39.014 38.95 38.92 38.90 38.79 38.63
beagle-genotypes-phasing 5.1 4 220722 220208 5.4 5.2 5.1-200518 5.1-191125 5.0-180928 4.1~180127
bedops 2.4.39 2.4.26 7 2.4.416 2.4.402 2.4.39 2.4.37 2.4.35 2.4.26
biobambam2 9999 2.0.146 5 2.0.185 2.0.1832 2.0.182 2.0.179 2.0.177 2.0.95
bismark 0.23.0 3 0.24.12
boost 1.74.0 54 1.83.022 1.82.014 1.81.0.1~exp1 1.81.09 1.80.08 1.79.06 1.78.012 1.77.05 1.76.09 1.76 1.75.010 1.74.0.3 1.74.0.3ubuntu7 1.74.0.3apertis1 1.74.07 1.73.05 1.72.07 1.71.07 1.71.0.0ubuntu2 1.70.03 1.69.09 1.68.03 1.67.0.1 1.67.0.1co2 1.67.03 1.66.09 1.65.14 1.65.1.0ubuntu1 1.64.0 1.63.03 1.62.0 1.61.0 1.60.0 1.59.04 1.58.0.1ubuntu1 1.58.02 1.55.04 1.54.0.1ubuntu1 1.54.02 1.53.2 1.53.02 1.52.0 1.48.0 1.44.0 1.41.03 1.33.1 0.5 3.1.185 1.80.0.r69.g1009df2416 HEAD develop 20120824
braker 2.1.2 2 2.1.6
brlcad 9999 7.32.4 11 7.36.06 7.34.2 7.32.6 7.32.2 7.26.0 7.24.0
charls 2.3.4 23 2.4.213 2.4.14 2.4.0 2.3.45 2.2.1 2.2.05 2.1.03 2.0.05 1.1.04 1.06 2.0.0.1.gd93464b HEAD
datalad 0.18.3 0.18.1 0.18.0 8 0.19.35 0.18.4 0.18.3 0.18.2 0.18.1 0.16.5 0.15.6 0.15.5 0.14.7 0.14.0 0.12.4 0.11.2 0.9.3
dcm2niix 1.0.20210317 1.0.20201102 9 1.0.202304113 1.0.202207204 1.0.202110062 1.0.20201102 1.0.20190902 1.0.20181125 1.0.20180622 1.0.20171215 0.0.0 HEAD
diamond-aligner 2.0.6 10 2.1.86 2.1.7 2.1.62 2.1.4 2.1.3 2.1.1 2.0.15 2.0.14 2.0.7 0.9.36 0.9.30 0.9.24 0.9.17 0.8.36 0.9.27.r1.g58ee82e
dipy 1.1.1 2 1.7.0 1.6.0 1.4.1 1.3.0 0.13.0 0.10.1 0.5.0
easybuild 4.6.2 2 4.7.0
elmerfem 9.0 10 2023.08.25 2023-02-03 9.05 8.42 6.1.0.svn.5396.dfsg2 5.2.0 9.0.r741.g7665920e
embree 3.13.0 3.12.2 3.12.1 3.12.0 28 4.2.014 4.1.02 4.0.1 3.14.4 3.13.514 3.13.42 3.13.38 3.13.2 3.13.12 3.13.02 3.12.23 3.12.14 3.12.0 3.11.0 3.9.0 3.8.02 3.7.0 3.6.1 3.6.0-beta 3.5.2 3.0.0 3.0.0-beta 2.17.72 2.17.6 2.17.42 2.17.2 2.17.0 2.16.0 HEAD
ensmallen 2.16.2 2.16.0 2.15.1 2.15.0 2.14.2 14 2.19.18 2.19.0+git20220630.1.adf2fc8 2.19.06 2.18.2 2.17.02 2.16.2 2.14.22 2.12.1 2.12.0 2.11.3 2.11.1 2.10.3 HEAD
environment-modules 4.6.0 16 5.3.17 5.3.02 5.2.03 5.1.1 5.1.0 5.0.13 5.0.02 5.0.0-alpha 4.8.02 4.7.12 4.7.02 4.6.1 4.6.0 4.5.3 4.5.22 4.4.12 4.3.0 4.2.4 4.2.3 4.2.2 4.2.1 4.1.42 4.1.2 4.1.1 3.2.106 main
fastqc 0.11.9 9 0.12.16 0.11.93 0.11.8 0.11.5 0.11.4 0.10.1
fgsl 1.3.0 7 1.5.02 1.4.0 1.3.0 1.2.0 1.5
forge-visualizations 9999 1.0.7 1.0.5 8 1.0.85 1.0.4 1.0.1 0.9.2 1.1.0_af3.2.2.r418.g735e642
frama-c 22.0 8 27.12 26.12 25.04 24.04 23.12 22.0 21.12 20.0 19.1 18.0 17.0 16.0 15.0 1.14 20201209+titanium 20191204+calcium 20171101+sulfur 20170501+phosphorus 20151002+magnesium 20130601+fluorine3 20220511-manganese
freebayes 1.3.5 8 1.3.73 1.3.64 1.3.5 1.3.22 1.3.1 1.2.0 1.1.0 HEAD
freefem++ 4.10 4 4.133 4.12 4.112 4.9 4.7 4.6 4.4.2 3.62 3.61.1 3.60 3.59 3.56 3.51 3.47 3.38.1 3.26-2
fsl 6.0.5 6.0.4 6 6.0.7.2 6.0.5 5.0.8 4.1.9 2.3 1.7.0
fsleyes 1.5.0 2 1.8.2
fsleyes-props 1.8.2 2 1.10.0
fsleyes-widgets 0.12.3 2 0.14.3
gdcm 3.0.14 16 3.0.224 3.0.218 3.0.203 3.0.19 3.0.172 3.0.142 3.0.122 3.0.11 3.0.104 3.0.93 3.0.82 3.0.7 3.0.6 3.0.5 3.0.1 2.8.9 2.8.82 2.8.43 2.6.5 2.6.3 2.2.4 2.6.6.364.g05a664a
genepop 4.7 3 4.7.5 4.5.1
gffcompare 0.12.2 5 0.12.62 0.12.1 0.10.15-1.be56ef4
glbinding 3.1.0_p1 11 3.3.04 3.1.06 2.1.4 2.1.1 2.1.3.r105.gc9909596
glean 1.0.1 1 1.23.0
irods 4.2.11 4 4.3.02 4.2.11 4.2.8 4.2.7
ittapi 3.24.0 3.23.0 3 3.24.2 3.24.0 3.23.0 HEAD
jwnl 1.4_rc2 7 1.4 1.4-rc7 1.4-rc33 1.4~rc3
kaks-calculator 2.0 1.2 3 3.0 2.0
king-unclassified 2.2.7 1
lastz 1.04.03 6 1.04.225 1.04.15 1.04.032 HEAD 1.04.22+git20221105.1.e66c1da
libbigwig 9999 0.4.4 8 0.4.75 0.4.6 0.4.43
libdeflate 9999 1.11 1.9 1.8 1.7 1.6 33 1.1915 1.1817 1.174 1.154 1.143 1.12 1.10+git20220309.1.e26a99e 1.104 1.92 1.82 1.72 1.5 1.2 1.15.r0.g0201338
libmaus2 9999 2.0.689 5 2.0.813 2.0.810 2.0.802 2.0.786 2.0.768 2.0.767 2.0.611
lief 0.11.5 5 0.13.23 0.13.13 0.13.0 0.12.33 0.12.2 0.12.0 0.11.5 0.10.1 0.9.0 0.11.0.r224.g12c5bf44
Project Selected Spr Newest Outdated Ignored
links 2.0.1 44 2.2929 2.288 2.272 2.262 2.257 2.235 2.22 2.215 2.20.24 2.20.1 2.19 2.18 2.172 2.162 2.155 2.147 2.133 2.123 2.11 2.10 2.9 2.83 2.72 2.6 2.5 2.4 2.3 1.04 1.032
ltl2ba 1.1 8 1.37 1.2 1.1
makefile2graph 9999 1.5.0 9 2021.11.066 2018-01-03 1.5.03 1.5.0.r16.g656a5a9 HEAD 2021.11.06+git20220706.1.88fcbd6
memkind 9999 1.11.0 1.10.1 10 1.14.05 1.13.05 1.12.0 1.11.03 1.10.12 1.10.05 1.9.03 1.8.0 1.7.02 1.6.0 1.5.02 1.4.0 1.1.03
mesquite 2.3.0 3 3.81_build955 2.99
minimap2 2.24 9 2.265 2.25 2.244 2.22 2.172 2.15 2.24.r39.g5e72423
minipro 0.5 14 0.68 0.56 0.4 0.3 0.22 0.1 0 0.6.r15.g0c1e950 HEAD
mmg 5.5.2 5.5.1 5.5.0 7 5.7.14 5.6.0 5.5.22 5.4.32 5.4.1 5.4.0 5.3.13 5.3.11 5.7.0.2.ge04216d1
mmseqs2 13.0 6 14-7e2844 13.45111 13-45111 12-113e3 9-d36de HEAD
motioncor2 1.4.0 3 01302017 1.4.7
mpremote 0.4.0 3 1.20.02
mrfast 2.6.0.1 2 2.6.1.0
ncbi-vdb 2.11.2 6 3.0.23 2.11.2 2.11.0 2.10.9 2.10.6 2.10.3 2.9.3 2.8.2-2
ngs-ncbi 2.11.2 5 3.0.12 2.11.2+git20220215.1.5be0fb5 2.11.2 2.10.9 2.10.5 2.10.2 2.10.0 2.9.3 1.3.0 1.2.3
nibabel 5.0.0 4.0.0 2 5.1.0 5.0.0 3.2.2 3.2.1 2.5.1 2.3.2 2.2.1 2.0.2 1.2.2
nipype 1.8.4 1.5.0 2 1.8.6 1.8.5 1.7.0 1.6.0 1.1.8 1.0.0+git69-gdb2670326 0.11.0 0.9.2
nitime 9999 0.9 2 0.10.1 0.9+git20211001.1.d2d5583 0.9 0.8.1 0.7 0.6 0.4
noweb 2.12 12 2.133 2_13 2.124 2.11b5
ocaml:lacaml 11.0.8 7 11.0.10 11.0.83 9.3.22 9.1.1 8.0.7 7.0.13
onedpl 2022.2.0 2022.0.0 2021.7.1 5 20200330 2022.0.02 2021.7.02 2021.6.1
optpp 2.4 5 20220920 2.43
pbbam 2.1.0 6 2.3.0 2.1.03 2.0.0 1.6.02 1.0.6 0.19.0 0.18.0 0.7.4
pbcopper 1.9.5 4 2.2.0 2.0.02 1.9.3 1.8.0 1.3.0 0.4.1 0.0.1+20161202
perl:bio-db-das-chado 0.35 2 0.35a 0.35
perl:text-parsewords 3.30 12 3.313 3.305 3.292 3.310.02 3.300.03 3.290.0
perl:time-progress 2.12 13 2.144 2.12+git20220528.1.ce8adfd 2.123 2.11 2.0.02 1.700.02 1.8 1.7 2.140.03 2.120.0
perlprimer 1.1.21 4 1.2.42 1.2.3 1.1.212 1.2.4+git20181123.1.f415ea6
plog 9999 1.1.5 8 1.1.104 1.1.93 1.1.6 1.1.5_p20200501 1.1.5
praat 6.1.42 19 6.3.178 6.3.162 6.3.15 6.3.143 6.3.103 6.3.07 6.3.03 6.3 6.2.102 6.2.09 6.1.55 6.1.48 6.1.41 6.1.38 6.1.16 6.1.10 6.1.09 6.0.48 6.0.46 6.0.38 6.0.37 6.0.21 6.0.18 6.0.4 5.4.04 5.3.16 5.2.17 6.1.09.r104.g9db902f 6.3.18
pulp 2.7.0 3 16.0.2 2.15.2 2.13.4 2.12.2
python:affine 2.3.0 13 2.4.010 2.3.14 2.3.0+git20210212.1.78c20a0 2.3.07 2.2.22 2.2.1 2.2.0 2.1.02 2.0.0.post1 1.2.0
python:anys 0.2.1 2 0.3.0
python:archspec 0.1.4 6 0.2.15 0.1.42
python:asdf 2.14.3 10 2.15.14 2.15.04 2.14.3 2.13.0 2.11.1 2.9.2 2.8.1 2.7.2 2.5.1 2.3.2 1.3.3
python:astropy 5.2.1 14 5.3.35 5.3.2 5.3.12 5.3 5.2.23 5.2.1 5.22 5.1.12 5.13 5.0.3 5.0 4.3.13 4.22 4.0.2 4.0.1.post1 4.0 3.2.3 3.2.1 3.1.2 3.0.5 3.0.4 3.0.1 2.0.92 2.0.8 2.0.5 2.0.4 2.0.3 2.0.2 1.3.3 1.1.12 0.3
python:astropy-healpix 0.7 9 1.0.05 0.73 0.63 0.52 0.4 0.3.1 0.2
python:av 8.0.3 8 10.0.07 9.2.02 8.1.0+git20220210.1.95b4f81 8.1.0 8.0.32 8.0.2 6.2.0 9.2.0.r10.g1d892a7
python:bokeh 2.4.2 12 3.3.0.dev1 3.2.25 3.1.1 2.4.34 2.4.2 2.3.3 2.3.2 2.3.0 2.2.3 2.2.1 1.4.0 0.12.15
python:cadquery 2.2_rc20220506 4 2.3.1 2.1.r531 2.0 2.1.r474.gec54a38
python:cadquery-ocp 7.5.3.0 2 7.7.1
python:ccdproc 2.3.0 5 2.4.13 2.3.0 2.1.0 2.0.1 1.3.0-post1 1.2.0
python:distinctipy 1.2.2 2 1.2.3
python:dpnp 0.11.1_rc1 2 0.12.1
python:extension-helpers 1.0.0 13 1.1.03 1.0.06 0.17
python:ezdxf 0.16.5 8 1.1.02 1.0.32 1.0.2 1.0.1 0.18.12 0.17.2 0.16.3 0.12
python:fiona 1.9.0 12 1.9.4.post15 1.9.43 1.9.33 1.9.2 1.9.12 1.8.224 1.8.212 1.8.204 1.8.17 1.8.13 1.8.6 1.8 1.7.13 1.7.10 1.7.8 master
python:fscacher 0.2.0 0.1.4 2 0.4.0
python:fslpy 3.10.0 3 3.14.1 3.13.3 3.11.1 3.9.0 3.8.2 3.6.4 3.5.3 3.4.0 3.3.0 3.0.1 2.8.1 2.7.0 2.6.1 1.12.0
python:gammapy 1.0 4 1.12 0.18.2
python:geopandas 0.13.2 12 0.14.05 0.13.25 0.13.0 0.12.25 0.12.12 0.11.12 0.10.24 0.9.0 0.8.22 0.8.1 0.7.02 0.6.3 0.5.1 0.5.0 0.4.1 0.4.02 0.3.02 0.1.1 master
Project Selected Spr Newest Outdated Ignored
python:google-cloud-storage 2.7.0 11 2.11.03 2.10.05 2.9.0 2.8.0 2.7.02 2.5.02 2.4.0 2.3.02 2.2.1 2.1.0 1.42.3 1.42.1 1.42.0 1.23.0
python:gwcs 0.18.3 6 0.19.02 0.18.32 0.15.0
python:hdbscan 0.8.29 7 0.8.334 0.8.29 0.8.28 0.8.27
python:hdmf 3.5.2 3.5.1 3.5.0_p1 3.4.7 3 3.9.02 3.5.1 3.4.7 3.4.5 3.1.1 2.1.0 2.0.1 1.6.1 1.6.0 1.2.0 1.1.2 1.0.1
python:heudiconv 0.13.0 0.11.6 3 1.0.0 0.13.1 0.12.2 0.8.0
python:holoviews 1.15.3 5 1.18.0a1 1.17.14 1.15.4 1.15.2 1.14.9 1.14.6 1.13.2 1.6.2
python:interleave 0.2.0 2 0.2.1
python:llvmlite 0.40.1 0.39.1 16 0.41.0 0.41.0dev0 0.40.15 0.40.02 0.40.0rc1 0.39.16 0.38.1 0.38.0 0.37.02 0.36.0 0.35.0 0.34.0 0.31.0 0.28.0 0.22.0 0.42.0dev0.r2.g2488e03
python:matlabengine 9.13.7 3 9.15.2 9.14.3
python:meshpy 2020.1 5 2022.1.33 2018.2.1
python:mkl-fft 1.3.1 3 1.3.6 1.3.6.anaconda1 1.3.1
python:mkl-random 1.2.2 3 1.2.4 1.2.2 1.2.2.anaconda1
python:mkl-service 2.4.0 4 2.4.0.post12 2.4.0 2.4.0.anaconda1
python:multimethod 1.8 4 1.9.13 1.6
python:neo 0.11.1 0.11.0 6 0.12.04 0.11.1 0.11.0 0.10.22 0.10.1 0.10.02 0.9.0 0.8.0 0.6.1 0.5.2.r205.gc66dbfe
python:num2words 0.5.10 12 0.5.129 0.5.107 0.5.92 0.5.7 0.5.63 0.5.4
python:numba 0.57.1 0.56.4 16 0.58.0 0.57.15 0.57.02 0.56.45 0.56.2 0.55.22 0.54.1 0.53.1 0.52.0 0.51.2 0.37.0 0.26.0 0.59.0dev0.r7.gd70830f22 2023-08-11
python:numba-dpex 0.20.0_rc3 2 0.21.2
python:numpy 1.23.5 45 1.26.09 1.26.0_rc1 1.26.0_beta1 1.25.215 1.25.13 1.25.02 1.24.43 1.24.34 1.24.3.anaconda1 1.24.24 1.24.13 1.24.0 1.23.52 1.23.4 1.23.34 1.23.2 1.22.4 1.22.32 1.22.22 1.22.02 1.21.62 1.21.53 1.21.44 1.21.23 1.21.1 1.20.3 1.20.2 1.20.12 1.19.54 1.19.44 1.19.2 1.19.1 1.18.5 1.18.42 1.18.2 1.18.1 1.17.43 1.17.32 1.17.2 1.17.0 1.16.610 1.16.55 1.16.44 1.16.32 1.16.22 1.16.12 1.15.43 1.15.12 1.14.5 1.14.32 1.14.22 1.14.1 1.14.0 1.13.32 1.12.1 1.11.02 1.10.43 1.9.3 1.9.2 1.8.23 1.8.1 1.8.0 1.7.2 1.7.12 1.4.12 1.25.0rc1.r220.g857a8f7aea main HEAD
python:nwbinspector 0.4.26 0.4.19 2 0.4.30
python:panel 0.14.2 7 1.2.33 1.2.22 0.14.42 0.14.1 0.13.0 0.12.1
python:param 1.12.3 1.10.1 11 2.0.0a3 1.13.09 2.0.0a2 2.0.0a1 1.12.3 1.12.22 1.12.1 1.12.03 1.9.32 1.9.2 1.6.0 1.4.2
python:photutils 1.6.0 9 1.9.03 1.7.0 1.5.02 1.1.0 1.0.2 1.0.1 0.7.22 0.7.1 0.6 0.5 0.4 0.3.2 0.3
python:plac 1.3.5 11 1.4.02 1.3.58 1.3.4 1.3.3 1.1.0 0.9.6 20170202
python:probeinterface 0.2.16 0.2.14 3 0.2.172 0.2.16 0.2.11 0.2.7
python:pybigwig 9999 0.3.18 0.3.17 7 0.3.223 0.3.21 0.3.20 0.3.18 0.3.12
python:pybind11-stubgen 0.10.4 5 2.2 0.12.02 0.8.7
python:pyct 0.4.8 9 0.5.07 0.4.83 0.4.62
python:pyerfa 2.0.0.1 12 2.0.0.37 2.0.0.2 2.0.0.16 2.0.02 1.7.1.12
python:pynndescent 0.5.6 10 0.5.105 0.5.82 0.5.7+git20220917.1.d9eb72e 0.5.72 0.5.5 0.5.2 0.4.7
python:pynwb 2.3.2 2.3.1 2.2.0 3 2.5.0 2.3.3 2.1.0 2.0.0 1.4.0 1.3.3 1.2.1 1.1.0 1.0.3 0.6.1
python:pyout 0.7.2 0.7.1 2 0.7.3
python:pysolar 0.10 6 0.113 0.10 0.9 0.8 0.8~rc1 0.7+gite32d755 0.62 0.5+git4720b36403
python:pytest-doctestplus 0.12.1 9 1.0.02 0.13.02 0.12.12 0.12.02 0.11.22 0.11.0 0.9.02 0.8.0 0.7.0 0.5.0 0.3.03 0.1.3 0.1.2
python:python-igraph 0.10.4 13 0.10.88 0.10.62 0.10.44 0.10.4-0.b6ebd8e 0.10.22 0.9.11 0.9.103 0.9.93 0.9.8 0.9.6 0.9.0 0.8.3 0.8.2 0.8.02 0.7.1.post62 0.7.1post6 0.7.0 0.7 0.6.5
python:pytorch-lightning 1.8.6 8 2.1.0rc0 2.0.9 2.0.8 2.0.7 2.0.3 2.0.22 2.0.0 1.6.52 1.6.3 0.8.5 1.5.0.r244.g2faaf35b91
python:pyvista 0.33.2 8 0.42.2 0.42.12 0.39.13 0.37.0 0.34.2 0.33.2
python:pyviz-comms 2.2.0 7 3.0.02 2.3.2 2.2.13 2.2.0 2.1.0 0.7.3 0.7.0
python:rasterio 1.2.10 11 1.3.8.post1 1.3.87 1.3.7 1.3.63 1.3.42 1.3.2 1.3.0 1.3 1.2.103 1.2.8 1.2.62 1.2.4 1.2.32 1.2.1 1.1.84 1.1.5 1.1.4 1.1.3 1.0.28 1.0.22 1.0.18 1.0.2 1.0a12 master
python:rasterstats 0.16.0 5 0.19.03 0.17.0
python:reproject 0.8 9 0.12.02 0.11.0 0.10.02 0.9.1 0.9 0.83 0.7.13 0.5.1 0.4 0.3.2 0.3.1
python:schema 0.7.4 17 0.7.513 0.7.43 0.7.3 0.7.22 0.7.1 0.7.0 0.6.8 0.6.72 0.6.6 0.5.02 271.bca292f
python:scooby 0.5.7 8 0.7.24 0.5.122 0.5.11 0.5.7
python:smart-open 6.3.0 11 6.4.03 6.3.06 6.2.0 6.0.02 5.2.13 5.1.0
python:snakemake 7.32.3 3 7.32.4 4.3.0.964.g86d6434c
python:specutils 1.9.1 3 1.11.02
python:sphinx-astropy 1.8.0 4 1.9.12 1.7.0
python:sphinx-automodapi 0.14.1 8 0.16.02 0.15.02 0.14.13 0.13
python:spikeinterface 0.97.0 0.96.1 2 0.98.2
python:traits 6.4.1 6.3.2 12 6.4.26 6.4.15 6.3.24 6.3.1 6.2.02 6.1.12 5.2.03 5.1.2 5.1.12 5.0.0 4.6.02 4.5.02 4.4.0 4.3.0 4.1.0
Project Selected Spr Newest Outdated Ignored
python:transforms3d 0.3.1 6 0.4.14 0.3.12 0.3 2019-12-17
python:tridesclous 1.6.6 1.6.4 2 1.6.8
python:umap-learn 0.5.2 9 0.5.43 0.5.34 0.5.12
python:wraps 0.2.0 2 0.6.1
python:zarr 2.12.0 2.11.3 10 2.16.14 2.16.04 2.14.22 2.13.32 2.12.0 2.11.3 2.11.12 2.10.22 2.10.1 2.9.5 2.8.1 2.6.1 2.5.0 2.4.0 2.3.2 2.3.1
python:zarr-checksum 0.2.8 2 0.2.9
qcl 0.6.4 6 0.6.73 0.6.42
qgraf 3.6.5 3 3.6.6 3.4.2
rdkit 2021.09.4 9 202303.3 202209.3 202109.2 202009.4 201909.1 201809.1 201603.5 201503 201309 2023.03.32 2023_03_2 2023_03_1 2022.03.5 2019.03.3 2018.03.4 2018.03.2 2016.09.4 2016.3.1 2015.3.1 2013.3.2 20161007 HEAD
ripser 1.1 4 1.2.13 1.1.20200206.286d36 1.0
rivet 3.1.7 3.1.6 3.1.5 6 3.1.83 3.1.7 3.1.62 3.1.5 3.1.3 3.1.2 3.1.1 2.6.0 2.5.4 2.5.2 1.8.3 3.1.8.r212.g72aacf9c0
ruby:rails 1.5.1 23 7.0.86 7.0.7.23 7.0.7 7.0.5.12 7.0.4.33 7.0.2.32 7.0.1 6.1.7.63 6.1.7.4 6.1.7.3 6.1.7.2 6.1.7.1 6.1.4.7 6.1.4.4 6.1.4.13 6.1.4 6.1.3.2 6.1.2.1 6.0.6.1 6.0.3.7 6.0.3.4 6.0.3.3 6.0.2.2 5.2.8.1 5.2.4.3 5.2.4.1 5.2.33 5.2.2.1 5.2.2 5.2.12 5.1.7 5.1.6 5.1.5 5.1.42 5.0.7.2 5.0.2 4.2.11.3 4.2.10 4.2.62 4.2.5.1 4.2.4 4.1.1 4.0.2 3.2.19 3.2.18 3.2.16 3.2.13+1 3.0.5 2.3.5 1.5.1 1.1.6
scilab 6.1.1 22 2023.1.04 6.1.1+git20210715.1.81a9cc0 6.1.18 6.1.04 6.0.24 6.0.13 6.0.0 5.5.26 5.5.1 5.5.0 5.2.2 4.1.2 4.1 6.2.0.r216.g81a9cc04933
seqtk 1.3 10 1.47 1.3+git20220515.1.b98236d 1.34 1.2 1.0 1.2.r102.32e7903
simpleitk 1.2.4 5 2.2.12 2.1.1.2 2.1.1 2.0.2 1.0.1 2.3.0
snpeff 4.3t 8 5.13 4.3t3 2017-11-24 5.1+d
spades 3.15.3 8 3.15.57 3.15.42 3.15.3 3.13.1 3.13.0 3.11.1 HEAD
sra-tools 2.11.3 6 3.0.8 3.0.63 3.0.3 2.10.6
ssake 3.8.2 2 4.0.1 4.0 3.8.4 3.8.1 4.0.1+git20221223.1.f495a84
stacks 2.60 9 2.65 2.622 2.603 2.59 2.55 2.53 2.412 2.4 2.2 2.1 2.0Beta8c 1.35 1.9.13 1.9.12 1.9.10 1.9.7 1.9.6 1.9.5 1.9.4 1.9.3 1.9.2 1.9.1 1.9.0 1.8.3 1.8.2 1.8.1 1.8.0 1.7.6 1.7.5 1.7.4 1.7.3 1.7.1 1.7.0 1.6.3 1.6.2 1.6.1 1.5.7 1.5.6 1.5.5 1.5.4 1.5.3 1.5.2 1.5.1 1.4.7 1.4.6 1.4.5
stringtie 2.1.5 10 2.2.14 2.2.0 2.1.42 2.1.13 1.3.6
subread 2.0.3 8 2.0.64 2.0.5 2.0.4 2.0.33 2.0.2 2.0.12 2.0.0 1.6.3 1.6.0 1.5.0-p1
tabixpp 1.1.0 5 1.1.23 1.1.0 1.0.0.10 1.0.0
torchvision 0.14.1 3 0.15.22
transdecoder 5.5.0 5 5.7.13 5.5.0 5.0.1 2.0.1
trf-tandem-repeats-finder 4.09 5 4.09.13 4.09 4.04
trinityrnaseq 2.13.2 4 2.15.1 2.15.1.FULL 2.13.2 2.11.02 2.6.6 2.5.1
ugene 40.1 10 48.13 47.0 46.0 45.12 44.03 42.0 40.12 37.0 35.0 34.02 33.02 1.31.1.1+rb2 1.31.13 1.31.0 1.29.0 1.28.1 1.27.0 1.26.1 1.26.0 1.25.0 1.9.8 38.1.r485.g113d9908d0
varscan 2.4.4 5 2.4.6 2.4.4 2.4.32 2.4.2 2.3.9
vcflib 1.0.3 5 1.0.92 1.0.7 1.0.1 1.0.3.r330.ga36dbe9
vxl 2.0.2 10 3.5.03 3.3.23 2.0.23 1.18.0 1.17.02 1.17.0-nix1 1.17.0.dfsg2
xgboost 1.6.2 14 2.0.0 1.7.67 1.7.5 1.7.42 1.6.22 1.5.23 1.5.0 1.2.1 0.902 0.7 r6119.b05abfc49 master
yaggo 1.5.10 4 1.5.112 1.5.10+git20180509.1.1199cff 1.5.102 1.5.4

Legend: